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microRNA芯片筛选发现血清血浆中的胃癌早期诊断标志物 应用案例

作者:admin 发布时间:2015.10.04 浏览:

microRNA芯片筛选发现血清血浆中的胃癌早期诊断标志物
2011/11/23 16:48:17 点击5105次

 

胃癌是世界第四大癌症,在所有癌症致死率排行中名列第二。每年都有超过一百万的病人被确诊为胃癌,其中75%来自亚洲。常见的胃癌相关生物标志物有癌胚抗原(carcinoembryonic antigen)和糖类抗原19-9(carbohydrate antigen 19-9),但这些生物标志物对于早期胃癌诊断的灵敏度和特异性都不高。由于缺乏明显的症状及早期诊断方法,胃癌患者通常在晚期被确诊,而此时的平均生存率只有7-9个月。因此,发现新的高灵敏度早期胃癌生物标志物相当重要。


microRNA是一类小分子非编码RNA,在调控基因表达方面发挥着重要作用。最近有研究表明,不同的肿瘤显示出特异性的microRNA表达谱,肿瘤来源的microRNA能被释放到循环系统中,进入血液组织。而在血液组织中,microRNA能避免被RNase降解,具有良好的稳定性。因此,血清血浆中的microRNA有成为肿瘤生物标志物的潜力。例如,最近的研究发现在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的血清中miR-21的含量比正常人群高。


在本文中,研究人员利用microRNA芯片,比较了胃癌患者与正常个体血清的microRNA表达谱,发现胃癌患者血清中,miR-378表达量高于正常人群。miR-378可以做为胃癌早期诊断的标志物。这一成果对于胃癌的早期诊断具有重要意义。相关microRNA芯片技术服务由上海伯豪生物技术有限公司/生物 芯片上海国家工程研究中心完成。



科学家们首先收集了7个胃癌患者、7个结肠癌患者和10个正常个体的血清样品,用Agilent公司的microRNA芯片进行microRNA表达谱分析,并对芯片结果进行RT-PCR验证。结果得到了7个在胃癌患者血清中高表达的microRNA。

 

microRNA芯片结果聚类图


 

随后用qRT-PCR的方法在另外收集的样品中对这7个microRNA进行进一步验证。使用U6 snRNA作为标准化内参,检测这7种microRNA的表达量,发现miR-187*,miR-371-5p,miR-378这三个microRNA在胃癌患者血清中特异性高表达。


随后,科学家们在大量样品中检测这三种microRNA诊断胃癌的能力,发现miR-378作为生物标志物的诊断价值最高,灵敏度达87.5%,特异性达70.73%,而增加另外两种microRNA联合诊断,并不能提高诊断价值。对比胃癌TNM分期不同病期样本血清中miR-378的表达量, 出国看病 ,发现miR-378在胃癌早期就有明显的表达上调,且与正常样本相比差别有显著意义。


综上所述,科学家们利用microRNA芯片发现miR-378在胃癌患者的血清中高表达,且在胃癌早期就有明显的表达上调。MiR-378作为生物标志物对胃癌进行诊断,灵敏度可达87.5%,特异性达70.73%.这一研究成果对于胃癌的早期诊断有重要意义。

 

 

原文出处:


Liu HS, Zhu L, Liu BY,Yang L, Meng XX, Zhang W, Ma YY, Xiao HS. Genome-wide microRNA profiles identify miR-378 as a serum biomarker for early detection of gastric cancer. Cancer Letters. 2011 Nov 2. [Abstract]

 

使用服务种类:Agilent miRNA芯片服务

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